مهمترین مسائل و مشکلاتی که اتباع ایرانی مقیم با آن مواجه هستند:
مهم ترین مسأله هموطنان عزیز در این کشور زندانیان ایرانی هستند که بعضاً بدلیل همسایگی دو کشور و ورود سهوی به آب های سرزمینی پاکستان توسط گارد ساحلی دستگیر و تحویل مقامات محلی می شوند. محبوس شدن در زندانهای پاکستان دارای آثار منفی روانی و معیشتی هم به فرد دستگیر شده و هم به خانوادهها آنان می باشد. زیرا اکثر این زندانیان بدلیل داشتن شغل ماهیگیری از تنها منبع درآمدی خود محروم می گردند.
در برخی از موارد نیز بدلیل سابقه فعالیت باندهای جعل مدارک در این کشور، احتمال کلاهبرداری توسط اتباع مسبوق به سابقه است. لذا قبل از هرگونه معامله و قرارداد با اتباع ایرانی و غیر ایرانی حتماً سوابق طرف معامله یا قرارداد از بخش اقتصادی سفارت استعلام گردد.