مهمترین مسائل و مشکلاتی که اتباع ایرانی مقیم با آن مواجه هستند:
در این کشور مهاجران و اتباع خارجی حتی بدون ویزا (بطور غیرقانونی) هم می‌توانندکار کنند اما وقتی گرفتار می‌شوند جریمه‌های سنگینی متحمل شده و احتمال اخراج آنها زیاد است. متاسفانه یکی از مشکلات ایرانیان نداشتن ویزای معتبر و اقامت قانونی است. تعداد قابل توجهی از ایرانیان با این معضل مواجه هستند. مشکل دیگر ایرانیان مسئله حساب بانکی است. بانک‌های این کشور عمدتاً برای ایرانی‌ها حساب باز نمی‌کنند و اخیراً حساب برخی از آنها را نیز مسدود کرده‌اند، موضوعی که بویژه پس از تشدید تحریم‌ها طی سال‌های اخیر نمود بیشتری پیدا کرده است. با توجه به شیوع ویروس کرونا تعداد زیادی از ایرانیان که شغل آزاد دارند به واسطه قرنطینه‌های طولانی مدت دچار مشکلات زیادی شده‌اند و بعضی از آنان بطور کلی دچار ورشکستگی شده و بدنبال شغل جدید هستند و برای تامین مخارج زندگی و اجاره مسکن در مضیقه می‌باشند. بطور کلی بزرگترین مشکل تعداد قابل توجهی از ایرانیان مقیم فیلیپین مشکل شغل و درآمد است که زندگی آنها را تحت تاثیر قرار داده است.