مهمترین مسائل و مشکلاتی که اتباع ایرانی مقیم با آن مواجه هستند:
مهمترین جرائم عبارتاند از نادیده گرفتن مقررات مربوط به قرنطینه، حمل مواد مخدر، مصرف مواد مخدر، درج مهر جعلی در گذرنامه، اقامت غیر مجاز، همراه داشتن گذرنامه جعلی، آزار جنسی، زورگیری و تهدید با سلاح سرد، سرقت از فروشگاهها، کار غیر قانونی، کلاهبرداری، نزاع و درگیری، اختلافات خانوادگی، فحشا. علاوه بر این ایرانیان مقیم که در مالزی اقامت قانونی و سالم دارند نیز با مشکلاتی در حوزه های مختلف از جمله مسدود شدن حساب های بانکی و سایر خدمات که از سوی برخی اپلیکشنها ارائه می شود روبرو هستند.